近日，中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院深圳農(nóng)業(yè)基因組研究所聯(lián)合崖州灣實驗室,、中國水稻研究所,、中國農(nóng)科院作物科學(xué)研究所和揚州大學(xué)等多個單位發(fā)布完整的水稻參考基因組,，實現(xiàn)了全基因組所有染色體端粒到端粒無缺口組裝,，為水稻育種研究提供了新的有力工具和重要大數(shù)據(jù)基礎(chǔ),。相關(guān)研究成果發(fā)表在《分子植物（Molecular Plant）》上,。

水稻是重要糧食作物,，其基因組組裝對水稻育種有重要意義,。自2005年水稻品種“日本晴”基因組草圖發(fā)布以來,，水稻研究正式跨入基因組學(xué)時代。此后，“日本晴”參考基因組在2013年進一步更新,，大幅改善了基因組組裝結(jié)果和基因注釋,，成為水稻的標(biāo)準(zhǔn)參考基因組并一直沿用至今。然而,，由于當(dāng)時測序和組裝技術(shù)限制,，該基因組對復(fù)雜結(jié)構(gòu)區(qū)域的組裝存在不足，仍有多個缺口未能解決,，占全長3%左右,，這些缺口阻礙了水稻育種的研究進程。

為此,，研究團隊以水稻“日本晴”為材料,，綜合利用新一代測序技術(shù)，完成了“日本晴”參考基因組的完整組裝,，其大小為385.7Mb,，每條染色體的端粒到端粒均由一條完整連續(xù)的序列組成，堿基精確度超過99.9999%,，最新的組裝新增了12.5Mb的基因組序列,，主要解鎖了水稻基因組中結(jié)構(gòu)最為復(fù)雜的核糖體DNA序列、著絲粒區(qū)域,、復(fù)雜轉(zhuǎn)座子序列和端粒區(qū)域等,，并修正了多個由于缺口導(dǎo)致的基因結(jié)構(gòu)錯誤，新增了1324個蛋白編碼基因注釋,。該研究為水稻育種研究奠定了重要理論基礎(chǔ),。

該研究得到國家自然科學(xué)基金、廣東省自然科學(xué)杰出青年基金,、中國農(nóng)科院青年創(chuàng)新專項和海南省院士創(chuàng)新平臺科研項目資金資助,。 

來源丨中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院基因組所

編輯丨農(nóng)財君

聯(lián)系農(nóng)財君丨18565265490

 新時代 新種業(yè)

南方農(nóng)村報丨農(nóng)財寶典

可能你還想了解  

KNOW MORE